经过艰苦的蹲守，秦志剑等人终于发现了薛怀礼的踪迹，准备采取行动。
秦志剑等人进入饭店，抓住了薛怀礼、李大兴，正要将他们带走时，贺刚和郑华军郑华军突然冲出，举枪射击。就在郑华军扣动板机的一瞬间，黄建强冲到高翔身前，挡住了子弹。黄建强倒下，一瞬间，刑警们都愣住了，急忙抢救黄建强。郑华军和贺刚却趁乱冲出饭店逃走。薛怀礼和李大兴被捕。
林荫接到秦志剑打来的电话，秦志剑报告了黄建强牺牲的情况，林荫流下悲痛的泪水……
秦志剑赶回清水，来到光华集团，追问郑光军，要他说出郑华军去向。郑说不知道，还表示他要提供一笔资金给烈士遗属。秦志剑冲向郑光军被其他刑警死死抱住了。秦志剑对着郑光军怒吼：“我饶不了你!”
再审薛怀礼和李大兴，他们也不知郑华军的下落，但是承认了贪污和陷害徐子民的犯罪事实。徐案彻底了结。
黄建强的牺牲，对罗厚平产生了巨大的震动，唤醒了他的良知，意识到自己以前跟着牛明是走错了路。他找到林荫，讲述了自己心路历程，流下愧疚的泪水，表示自己要顶上来，完成黄建强没有完成的任务。他告诉林荫，他对郑光军和牛明等人接触比较多，比较熟悉他们的情况，在和他们的斗争中，自己可以起到一些作用。他和林荫一起商量了一个计策……
林荫放出消息，说自己不久就要调走，并做出一些准备离任的举动。林荫特意对郝正说，自己要走了，让他帮着找几个纸箱，好收拾东西。郝正表面上对林荫表示惋惜，背地里却到处传说。郑光军和牛明听了郝正的述说，也十分得意。郑光军感到他们的好日子又要回来了，指示手下准备将郑华军接回过年。
林荫对郝正说自己就要离开了，让郝正派车把秀云接来，陪他几天。郝正爽快地答应了。
林荫和秀云去灵幻寺，没曾想却遇到郑光军带着陶素素来做佛事。林荫与郑光军对峙，唇枪舌剑。
林荫召开党委会，安排春节期间的值班等事项。他对大家说，这一段的工作由方政委主持，希望自己平安地离开清水。大家听后，心里都不是滋味。下班以后，林荫倍感孤独，这时严德才、徐子民等人先后来看他，令他感到欣慰。高翔也来了，林荫庄重地表示，过了年，一定要让高翔穿上正式的警服……黄建强的妻子刘玫带着儿子也来看望林荫，送给林荫一件毛衣，表示对林荫的感激，她请求林荫不要离开清水。
快过春节了，方政委向林荫提议去给有关领导拜年送礼，林荫拒绝了，说自己宁可不当公安局局长，也不干这种事。方政委无奈，问林荫真地就甘心放弃。林荫说当然不甘心，并将自
己的思路告诉了方政委，方政委很受鼓舞，表示支持……
雷雨行动第21集剧情介绍(大结局)年夜前夕，洪市长打来电话，请林荫到他家吃饭。
林荫来到洪市长家，开门的竟是苗雨，林荫十分惊讶，正在纳闷，洪市长告诉他一个消息：老曾出事了，省地纪检委联合调查组去了宝山，听说他已经被“双规”了。林荫并不感到意外，他知道像老曾那样的人，早晚要出事。这时，苗雨来叫他们吃饭，林荫才知道洪市长是苗雨的舅舅。饭桌上，苗雨表示过完年自己就离开清水。林荫从洪市长和夫人的话语中，意识到苗雨对自己的情感。
在与洪市长的交谈中，洪市长告诉林荫即使要把他调走，他也要站好最后一班岗，而且鹿死谁手还说不定。洪市长拿出一封信交给林荫，这是苗雨写给省纪检委的检举信，揭发万书记排挤林荫，勾结黑恶势力，搞权钱交易等腐败问题。林荫看后，既对苗雨感激，也为她担心，不知会有什么后果。洪市长却向林荫透露，省纪检委领导专门找过他谈话，了解万书记的问题。洪市长还说，这信已经寄出，自己也没有退路。鼓励林荫不要觉得这个世界就是万书记他们的了，而是很多人都在支持林荫。林荫感到自己正在实施的计划在这场斗争中非常关键，他向洪市长谈了自己的策略，谈了为什么目前如此低调。洪市长听后信心倍增……
苗雨送林荫离开洪市长家，告别时，苗雨说有很多人在支持他，希望他不要离开清水……
已在狱中服刑的沈勇突然要见林荫，说有重要的话要讲出来。林荫和方政委连夜赶到监狱，询问沈勇。沈勇说他盗窃市委大楼那个案子，他隐瞒了许多事实：仅仅在万书记办公室光现金就拿到十万，还有好几个存折，加起来有300多万，还有好几个案子，都有这种情况，但是在审问时自己都少说了，是牛明让他这么做的;牛明还保证，少说一点判得轻，还会有人照顾他的母亲。沈勇也想自己少说一些，等于是保护了市委书记，他肯定会照顾自己。可是，他们居然说话不算数，说从轻判，还判了12年，等到他刑满出去，母亲早死了。自己不如说出实情，抓几个贪官垫背。林荫和方政委听得目瞪口呆，几乎难以相信。
林荫和方政委迅速赶到地区，向谷局长做了汇报，谷局长表示，这件事交给他，让林荫和方政委马上回清水，集中精力突破郑光军的问题，这是解决万书记和整个清水问题的关键。
除夕之夜，公安局举办迎春团拜会，林荫致辞，向干警们表示感谢，并与大家说再见，希望大家保重。
牛明告诉郑光军林荫过了除夕就走，现在可以让郑华军回来了。
林荫、靳树林、秦志剑率领刑警们秘密监视光华集团总部。
郑光军打电话给陶素素，说郑华军就要回来了，邀陶一块来团聚。
贺刚潜回光华集团，报告郑光军，说郑华军随后就到。
陶素素给林荫打匿名电话，告诉林荫，郑华军一回到清水。郑华军突然闯入陶素素住处，要强暴陶素素，陶素素奋力反抗，却被郑华军杀害……
郑华军驾车来到光华集团总部，却落入了林荫他们的伏击圈。一番格斗后，抓住了郑华军，驶向公安局。
公安局里，郑华军故伎重演，装疯卖傻。牛明找借口想接近郑华军。林荫当机立断，立刻将郑华军押往地区公安局。
郑光军决定派刚逃回来的贺刚带人在半路上拦截公安局的车队，并告诉贺刚如果救不出郑华军，就干掉他。
林荫等人押送郑华军的车队遭到贺刚等歹徒的拦截。一场激烈的枪战展开，高翔身负重伤，依然用自己的身体压住了贺刚。 郑华军跑向同伙，却被击伤，刑警们将他摁在地上……
林荫抱起高翔，高翔用最后一口气对林荫说：“林局，给我穿上警服……”
一轮红日升起，照耀大地，照耀烈士的英灵。 (全剧终)
